تقوم فلاي بغداد بتشغيل احدث الطائرات في الاجواء حيث تملك اسطول يتكون من طائرتين من طراز بوينغ 700-737 و و اربع طائرات من طراز بوينغ 737-800 و طائرة من طراز 737-900ER واخرى من طراز بومبرديه CRJ-200
يبلغ متوسط عمر الطائرة ست سنوات تقريبا، و الشركة حاليا في طور شراء طائرات حديثة سيعلن عن نوعها و طرازها قريبا، اسطول الطائرات الجديدة سيدعم تشغيل العديد من الرحلات القصيرة والمتوسطة والطويلة في الشرق الاوسط